El potencial investigador de la Universidad Complutense se refleja tanto en su participación en las convocatorias externas de proyectos como en los 47 Institutos Universitarios de Investigación, que complementan la labor de los departamentos promoviendo la cooperación en líneas de investigación multidisciplinar. La investigación de la UCM cuenta además con 17 Centros de Asistencia a la Investigación (CAI) que, además de prestar servicio técnico, ponen a punto nuevas técnicas y crean nuevos escenarios para la I+D.