CEU-USP desarrolla una importante labor investigadora. Fomenta permanentemente su programa de Proyectos de Investigación, que se llevan a cabo en muy diferentes campos del saber.
La Universidad CEU San Pablo cuenta con 21 proyectos de investigación financiados por la Universidad con un total de 559.000? y 52 proyectos con financiación externa, por 1.721.000 euros, en los que participan 249 profesores.
El Instituto de Estudios de la Democracia y el Instituto de Estudios de la Familia, ambos de reciente creación, también están desarrollando proyectos de investigación.